二代测序技术在下呼吸道病原微生物谱分布特点及细菌耐药基因分析中的应用Application of next generation sequencing technology in the distribution of pathogenic spectrum isolated from lower respiratory tract and bacterial drug-resistant genes
朱丹燕,张猛飞,刘立群,张暋
摘要(Abstract)：
目的 了解呼吸道病原微生物谱分布及耐药情况，为临床用药提供参考。方法 应用二代测序技术对本实验室收集的705例下呼吸道样本进行微生物全基因组测序，并对耐药基因进行分析。结果 705份样本中阳性553份，占78.4%，微生物检出的总频次为1 435，其中细菌的检出频次占55.3%(794/1 435)，病毒的检出频次占25.6%(367/1 435)，真菌的检出频次占13.7%(197/1 435)，分枝杆菌属的检出频次占5.4%(77/1 435)。细菌中检出频次排序顺位为肺炎链球菌23.6%(187/794)，肺炎克雷伯菌13.0%(103/794)，鲍曼不动杆菌11.2%(89/794)，铜绿假单胞菌11.2%(89/794)，屎肠球菌11.0%(87/794)，普通病房和重症监护室的细菌谱分布存在差异。细菌中耐药基因共检出108株，其中鲍曼不动杆菌耐药基因菌株检出率31.5%(28/89)，主要为氨基糖苷类相关耐药基因、ade A/B/C外排泵相关基因、β-内酰胺酶基因和磺胺类抗菌药物耐药基因。肺炎克雷伯菌耐药基因菌株检出率25.2%(26/103)，主要为氨基糖苷类相关耐药基因、β-内酰胺酶基因和碳青霉烯酶耐药基因。铜绿假单胞菌主要检出氨基糖苷类相关耐药基因，嗜麦芽窄食单胞菌主要检出外排泵相关耐药基因，肺炎链球菌主要检出大环内酯类相关耐药基因，屎肠球菌主要检出氨基糖苷类相关耐药基因。结论 及时掌握下呼吸道致病菌分布情况及耐药的最新动态，可为临床医生合理使用抗生素提供依据，此外新技术有助于检出少见病原体，助力临床快速、精准诊断。
关键词(KeyWords)： 二代测序;呼吸系统;病原谱;耐药基因
基金项目(Foundation):
作者(Author): 朱丹燕,张猛飞,刘立群,张暋
DOI: 10.13515/j.cnki.hnjpm.1006-8414.2022.10.003
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