基于铝盐沉淀法富集污水中新型冠状病毒进行核酸检测的优化实验Optimization of nucleic acid detection for SARS-CoV-2 in sewage using aluminum salt precipitation
许太彬,孟庆玉,张祎洋,程春荣
摘要(Abstract):
目的 探究铝盐沉淀法富集污水中新型冠状病毒进行核酸检测时的最优实验条件,为污水中新型冠状病毒检测提供参考。方法 选取1份新型冠状病毒浓度阳性的污水样本,通过预离心、提取时加蛋白酶K、洗涤次数等条件的改变,分析不同实验条件对Ct值、重复性、核酸浓度及纯度的影响。结果 预离心(F=3.203,P<0.05)和蛋白酶K(F=2.688,P<0.05)对Ct值的影响差异无统计学意义,洗涤1次未检测到ORFlab基因,洗涤2次和洗涤3次对Ct值的影响有统计学差异(F=111.259,P<0.05)。预离心、洗涤3次得到的核酸检测重复性最好,变异系数CV值为1.30。洗涤次数增加时,核酸浓度下降,A260/A280和A260/A230比值升高,经过预离心、加蛋白酶K、洗涤3次得到了纯度最高核酸样本(A260/A280=1.87±0.02、A260/A230=0.90±0.04)。结论 采用铝盐沉淀法富集污水样本的新型冠状病毒进行核酸检测时,预离心、加蛋白酶K、洗涤3次是最优的实验条件,该条件下检测Ct值的平均值较小、重复性更好。
关键词(KeyWords): 铝盐沉淀;病毒富集;新型冠状病毒;Ct值
基金项目(Foundation):
作者(Author): 许太彬,孟庆玉,张祎洋,程春荣
DOI: 10.13515/j.cnki.hnjpm.1006-8414.2025.05.010
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