柯萨奇病毒A6感染人横纹肌肉瘤细胞miRNA和mRNA表达测序分析Expression profiling of mi RNA and m RNA expression in human rhabdomyosarcoma cells infected with Coxsackievirus A6
黄熷远,付靖,赵亚,李懿,贺志权,闫君雅,仓顺东
摘要(Abstract)：
目的 探索柯萨奇病毒A6(coxsackievirus A6, CA6)感染人横纹肌肉瘤细胞（human rhabdomyosarcoma, RD）前后微小核糖核酸（micro ribonucleic acid, mi RNA）和信使核糖核酸（messenger ribonucleic acid, m RNA）的表达差异，分析预测CA6感染相关的mi RNA和m RNA作用方式。方法 使用CA6病毒株感染RD细胞，同时设置未感染对照组，分别在感染24、48和72 h收集染毒组和对照组细胞，采用荧光定量RT-PCR方法检测RD细胞染毒情况，筛选适宜的样本检测mi RNA和m RNA表达情况，进行相关生物信息学分析。结果 mi RNA通过影响细胞内的信号传导通路从而影响668个基因的表达，这些基因表达通路上的mi RNA富集程度最大。相关mi RNA富集程度最高的区域主要在细胞核和细胞膜蛋白所对应的8 009个和8 426个基因上。30个已知的mi RNA在染毒组和对照组的表达具有显著性差异。差异性表达的m RNA主要富集在代谢通路上且参与表达4个基因，在这4个基因当中有3个分别参与IL-17信号传导通路和百日咳细胞受体的表达。54个m RNA在染毒组和对照组的表达具有显著性差异。30个显著差异表达的mi RNA中有16个mi RNA关联到38个靶向调控基因。调控方式同时表现为一对多和多对一的关系，16个mi RNA和38个靶向调控基因表达趋势不具有完全一致性。结论 16个mi RNA在调节CA6病毒m RNA的表达中发挥重要作用，可进一步为CA6致病机制的研究和药物筛选提供依据。
关键词(KeyWords)： 柯萨奇病毒A6;人横纹肌肉瘤细胞;微小核糖核酸;信使核糖核酸;生物信息学分析
基金项目(Foundation): 河南省自然科学基金(222300420570);; 河南省科技研发专项(212102310161);; 河南省科技攻关计划联合共建项目(LHGJ20220051)
作者(Author): 黄熷远,付靖,赵亚,李懿,贺志权,闫君雅,仓顺东
DOI: 10.13515/j.cnki.hnjpm.1006-8414.2025.05.014
参考文献(References)：
- [1]徐德翠,陈瑶.儿童手足口病再感染危险因素及其模型构建[J].中华医院感染学杂志,2024,34(24):3808-3811.
- [2]刘鸽群,肖俊,谭徽,等.2009—2023年郴州市接种EV A71疫苗前后手足口病流行病学特征和病原学对比分析[J].预防医学情报杂志,2024,1-7.
- [3]纪洵敏,梁宇恒,何炽明,等.穿心莲内酯体外抗肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型的作用研究[J].中国热带医学,2025,25(1):62-68.
- [4]林宝山,邱婷婷.重症手足口病患儿使用糖皮质激素治疗的效果及对炎症因子、免疫功能的影响[J].中国现代药物应用,2024,18(19):110-112.
- [5]杨雅倩,郑志刚,潘沛江,等.CV-A6血清型手足口病重症病例临床风险分析[J].热带医学杂志,2024,24(9):1224-1229,1365.
- [6]张翠.手足口病患儿的病原体研究进展[J].中国城乡企业卫生,2024,39(9):38-40.
- [7] LIU J,WANG H,LUO H, et al. Knowledge, attitudes, and practices status among caregivers of infants and toddlers towards hand, foot and mouth disease:A cross-sectional study[J].BMC public health,2024,24(1):3339.
- [8] GU C, WU L, LI X. IL-17 family:Cytokines, receptors and signaling[J].Cytokine. 2013,64(2):477-485.
- [9]徐星洁,蒋志建,廖青玲.NLR、PLR联合CRP在感染性手足口病住院患儿诊断中的应用[J].罕少疾病杂志,2024,31(7):145-146.
- [10]苏勤.柯萨奇CVA4感染疾病模型创建及其在抗病毒药物筛选中的应用研究[D].扬州:扬州大学,2024.
- [11] ERNST K. Novel strategies to inhibit pertussis toxin[J].Toxins(Basel),2022,14(3):187.